Arbejdsprincippet for destillationssystemet er baseret på de forskellige kogepunkter for hver komponent i den flydende blanding. Den lave kogepunktkomponent fordampes ved opvarmning og kondenseres derefter til at adskille komponenterne. Den specifikke proces er som følger:
Opvarmningsproces: Den blandede væske opvarmes til delvis fordampning. I denne proces er komponenten med lav kogepunkt lettere at fordampe, mens den høje kogepunktkomponent forbliver i væsken.
Dampkondensation: Den fordampede damp kondenseres gennem kondensatoren og forvandles til væske igen. Den kondenserede væske opsamles for at opnå adskillelse af komponenter.
Damp-væske-interfase-masseoverførsel: I industrielt destillationsudstyr er den delvist fordampede væskefase i direkte kontakt med den delvist kondenserede gasfase for damp-væske-interfase-masseoverførsel. De ikke-flygtige komponenter i gasfasen overføres delvist til væskefasen, og de flygtige komponenter i væskefasen overføres delvist til gasfasen og opnår derved adskillelsen af komponenter.

